Jonatan teatr dizayni kurslariga o'qishga kirdi. O'qish paytida u turli spektakllarning sahna qo'yuvchisi bo'lib, televideniye va kino uchun promo-roliklar yaratib, ular aktyorlarning mukofotlardan oldin namoyish etilishiga xizmat qilgan. Uning "BBC" uchun ko'plab ishlar mukofotlar bilan taqdirlangan.
1993-yilda Jonatan Glazer Nik Morrison bilan faol hamkorlik qilgan. Reklama Akademiyasidan prodyuser bilan birga ular uchta film uchun ssenariylarni yaratib, keyinchalik ularni suratga olishgan.
Ikkki yildan so'ng Glazer musiqa videoindustriyasini zabt etishga yo'l olgan. Uning birinchi ishi Britaniyaning "Massive Attack" guruhining "Karmacoma" qo'shig'iga klip bo'lgan. Bir necha oydan keyin Glazer Amerika rok-guruhi "Blur"ning "The Universal" qo'shig'iga klip yaratgan. 1997-yilda "MTV" Jonatan Glazerga "Yil klipmeysteri" unvonini bergan. Uning ishlar eng originalardan biri sifatida tan olinmoqda.
2000-yilda "Seksual jonzot" trilieri chiqqan. Bu Glazer tomonidan suratga olingan birinchi to'liq metrajli film bo'lgan. Ushbu kinoproektda bosh rollarni ijro etgan Ben Kingsli "Oskar" mukofotiga nomzod bo'lgan.
2004-yilda Jonatan Glazerning yana bir rejissura ishi - "Tug'ilish" trilieri chiqqan. Ushbu film uchun amerikalik rejissyor ssenariyni ham yozgan. Deyarli 10 yildan keyin esa "Mening terimda bo'l" filmi prokatga chiqqan.
