В центре сюжета киноленты мы видим Тома Сойера — активного, инициативного, веселого и находчивого мальчика-сироту, находящегося под воспитанием у тетушки. Также у нее под контролем Сид — сводный брат Тома, который строит из себя послушного ребенка и ждет проступка братца, чтобы наябедничать на него.
Во время всех своих похождений Том становится очевидцем страшного убийства, успевает вывести преступника на чистую воду, затем ускользает из своей обители и живет некоторое время на необитаемом островке, а потом оказывается на своих же похоронах. После таких насыщенных событий, Том, на пару с подружкой Бекки, заплутался в пещере.
В конце фильма мы видим драматичную картину: ребята блуждают по подземным ходам в поисках выхода, уже теряя надежду на то, что им удастся выбраться из этой западни. Том мужественно отправляется искать помощь, оставляя обессиленную девочку, пообещав обязательно вернуться. Плутая по пещере, он натыкается на индейца, который пришел за спрятанным кладом, но Тому удается отправить его в «отключку».
Мальчик возвращается за Бекки, им уже почти удается выбраться наружу по веревочной лестнице, но Джо приходит в себя. Если бы не сообразительность Тома, то, возможно, ребята уже не вернулись бы домой.
По окончании своих злоключений Том обещает больше не попадать в подобные ситуации. Но уже к вечеру они с Геком отправляются в ту самую пещеру за сокровищами Джо и забирают их.
