Во время медового месяца Шрэк и Фиона получают приглашение от короля приехать во дворец. Герой не хочет встречаться с родными любимой, но она очень соскучилась по дому, поэтому уговаривает его согласиться.
Знакомство проходит ужасно: родители откровенно демонстрируют своё недовольство выбором дочери, к тому же они мечтали видеть рядом с ней сына крёстной-феи – принца Прекрасного.
Король нанимает киллера – Кота в сапогах – чтобы тот помог их семье избавиться от ненавистного великана. Но убийца не только не справляется с заданием, а наоборот становится его другом.
Шрэк отправляется за советом к фее, не догадываясь о том, что она днём и ночью работает над тем, чтобы разлучить его с Фионой и женить на принцессе своего сына, после чего Тридесятое царство, наконец, окажется в её руках. Крёстная девушки не упускает возможности отдалить супругов, поэтому убеждает героя, что если он любит свою жену, то ради их общего счастья должен оставить её в покое.
Опечаленный великан достаёт зелье, выпив которое он и его возлюбленная становятся людьми. Но чтобы в этом виде им остаться навсегда, они должны поцеловаться до полуночи. Фея обманом заманивает огра в ловушку и подсылает своего сына к принцессе, чтобы тот представился Шрэком. Однако обмануть любящее сердце не под силу никаким чарам — красавица с легкостью разоблачает самозванца.
В это время из заточения выбирается настоящий муж девушки. Тогда крёстная метает в него молнию, которая, ударившись о доспехи короля, рикошетом попадает в ведьму, и та погибает.
Принцесса знает, что после полуночи она снова станет зеленой великаншей, но даже когда часы начинают бить 12, она не целует мужа, потому что хочет остаться огром навсегда и жить на родном болоте. Отец девушки благословляет брак и превращается в лягушку.
