Рассказ о Такаки Тоно состоит из 3 частей, повествующих о его жизни на протяжении более 10 лет.
Первая часть «Отрывок о цветущей сакуре» повествует о детстве героя, в котором ему пришлось расстаться с любимой подругой Акари Синохара. После того как друзья окончили начальную школу, Акари переходит на учебу в другую префектуру, а потому друзья могут только переписываться. Семья Такаки должна переехать, и друзья вряд ли когда-нибудь встретятся. Тогда он решил рискнуть и увидеться с Акари, но планы природы не совпадают с планами парня. Его поездка с несколькими пересадками обречена на провал: сильный снегопад сбил график движения поездов, а потому он не успевает.
История «Космонавт» рассказывает об учебе в средней школе. Одна из школьниц влюбляется в Такаки Тоно. Канаэ Сумида несколько лет томится от любовных переживаний к переведенному парню, и только в 1999 году девушка решается сообщить Такаки о своих чувствах.
«5 сантиметров в секунду» - часть, в которой Такаки предстает перед зрителем уже взрослым. Он все время проводит на работе и очень устал от жизни. Уволившись, он отправляется бродить по вокзалу, где раньше со своей подругой детства Акари они любили гулять. И вот мимо него проходит девушка, в которой он узнает Акари. Они оборачиваются, чтобы посмотреть друг на друга, но между ними проезжает поезд, после чего девушка скрывается.
