События аниме «Экзорцизм. Хроники: Начало» разворачиваются в мире, где сверхъестественное зло существует рядом с людьми, хотя далеко не все готовы признать его реальность. В центре истории оказывается Пак Юн-гю – бывший врач, ставший католическим священником. После того как он начал заниматься изгнанием злых духов, церковь отлучила его, поскольку не поверила в существование тех сил, с которыми он столкнулся. За решением Пака оставить прежнюю жизнь стоит тяжелая личная история: когда-то он не смог защитить маленькую пациентку от неизвестного зла, и именно это заставило его посвятить себя борьбе с потусторонними сущностями.
Тем временем в Корее начинает разворачиваться гораздо более масштабная угроза. В течение нескольких столетий таинственная школа Хэдонского эзотерического буддизма скрывалась от внешнего мира. Ее 145-й наставник приступает к запретному ритуалу, намереваясь получить силу абсолютного зла. Для обряда используются человеческие жизни, а его последствия могут привести к катастрофе, способной уничтожить привычный порядок мира. Пять хранителей школы понимают, что самостоятельно остановить своего покровителя им будет трудно, поэтому привлекают к своей миссии Юн-гю.
Главной фигурой происходящего становится также мальчик Чан Чун-ху. На первый взгляд он кажется обычным и довольно наивным ребенком, однако в нем скрыта огромная духовная сила. Чун-ху оказывается связан с наследием восточной эзотерической традиции и становится важной частью пророчества. Именно поэтому на него обращает внимание могущественное зло, а его защита превращается в главную задачу героев. По задумке хранителей именно Юн-гю должен увести Чун-ху из ордена до финальной стадии обряда.
Несмотря на все старания хранителей, их наставник начинает финальную стадию обряда и злые силы уже готовились забрать Чун-ху. Теперь героям приходится не просто защищать мальчика, но и разобраться в происхождении угрозы и собственных страхах. Паку приходится вновь столкнуться с прошлым и причиной, по которой он когда-то выбрал путь священника и экзорциста.
В кульминации фильма противостояние становится масштабнее. Ритуал наставника приближает появление абсолютного зла, а героям приходится объединить различные духовные и боевые способности. Далеко не все из них останутся в живых после этой битвы. Фильм заканчивается масштабным столкновением с силами тьмы и одновременно работает как начало более крупной истории: именно в день, когда обезумевший наставник школы Хэдон был повержен, для главных героев начинается новая легенда. Финал оставляет пространство для дальнейшего развития этой вселенной.
