Братья Крис и Мартин Кратт – биологи. Эти двое исследуют живую природу и находят в ней странные и интересные особенности. В этот раз они следят за самкой крокодила, которая вскоре должна отложить яйца.
Крокодилиха разрывает ямку, в которую поместит будущих детёнышей. Братья должны пробраться туда, для этого они запрашивают поддержку у центра. Из штаба их курирует Авива, девушка с негативом относится ко всем земноводным и пресмыкающимся. Она высылает героям специальный супер-костюм, который уменьшает их до приемлемого размера. Благодаря костюму Кратты пробираются в углубление, животное засыпает его землёй и утаптывает, связь с центром пропадает. Вместе с героями здесь же оказываются несколько десятков яиц, которые будут находиться под постоянной температурой в 30 градусов. Температурные условия влияют на будущие потомство, поэтому все вылупившиеся детёныши будут девочками.
На гнездо хочет совершить нападение варан. Он раскапывает кладку и хватает одно из яиц. Кратт пытаются помешать ему, но безуспешно. Кажется, что судьба детёныша предрешена. Но на зов прибегает мама, которая отпугивает ящера. Она обратно закапывает кладку, Крис залезает внутрь, а Мартин садится верхом на крокодилиху. Авива понемногу начинает менять своё отношение к крокодилам, ведь даже они заботятся о своём потомстве.
Крокодилиха отправляется подальше от гнезда в сторону речки. Здесь она встречается со своими биологическими врагами – бегемотами. Рептилия одна, а этих животных целая стая, тем более с детёнышами, поэтому она не решается вступить в бой, а переплывает их под водой. В это время в гнездо откладывает свои яйца мягкотелая черепаха. Для будущих крокодильчиков это не опасно, но мама всё равно отгоняет земноводное подальше в кусты.
Вскоре яйца трескаются и из них вылупляются детёныши. Пространства в гнезде становится мало, и крокодил раскапывает ямку, чтобы всех освободить. Самка набирает своих детей в рот, Авива думает, что она их ест, но это не так, крокодилиха лишь переносит их на мелкий участок реки, а сама отправляется за пропитанием. В этот момент возвращается варан, следом за них барсук и цапля, все они не прочь поживиться крокодильчиками. Авива присылает Краттам современные костюмы крокодилов, с помощью которых они распугивают всех врагов. Через пару мгновений новейшая разработка перестаёт действовать и Краттам возвращаются их обычные тела. В эту же минуту крокодилиха решает проверить своё потомство и обнаруживает двух захватчиков. Она готова атаковать, но из воды появляется механический бегемот под управлением Авивы, который и спасает героев. Команда приходит к выводу, что нильские крокодилы – одни из самых заботливых родителей в дикой природе.
