Капитан Кирк наслаждается отпуском среди красот горной местности Калифорнии, но его срочно вызывают на службу. Перед экипажем новой версии корабля Enterprise поставлена ответственная миссия – вызволить из лап террористов на Нимбусе III человеческих и клингонских заложников. Однако по прибытию на место выясняется, что это хитроумная ловушка, а истинной целью ренегата по имени Сайбок является само легендарное межзвездное судно.
Злодей, к удивлению Спока оказавшийся его сводным братом, обладает ментальной силой чудовищной мощи. Лишь многоопытный Кирк, борясь с болью, может противостоять его внушению, но выбора у капитана нет. Он вынужден, ради спасения своей команды, сотрудничать с Сайбоком – тот отправляется в центр галактики, рассчитывая, что новейшие технологии Enterprise помогут прорвать скрывающий это место барьер.
Не без помощи со стороны авантюристу удается добраться до одинокой планеты Ша Ка Ри, где высадившийся десант обнаруживает нечто, выдающее себя за божество. Оно ведет себя как захватчик, требуя передать ему контроль над кораблем, чтобы покинуть это место. В одночасье прозревший и разочаровавшийся Сайбок вступает с монстром в бой – он принял решение пожертвовать собой и тем самым искупить вину.
Успевшие эвакуироваться на Enterprise члены экипажа прикрывают огнем с орбиты спасающихся от чудовища товарищей, но силы явно неравны. Отринув прежние распри, на помощь людям приходят клингонцы – общими усилиями им удается уничтожить таинственное создание, так и не сумев понять, с чем они столкнулись.
Отпраздновав вместе с новыми союзниками победу, Кирк сотоварищи возвращаются на Землю, наверстывать упущенный отпуск в горных лесах национального парка Йосемити.