Капитан Джеймс одержал новую победу – победил Хана и создал уникальную планету под названием Генезис. Но новый грандиозный триумф не греет сердце героя и не играет для него большой роли. Все это происходит из-за смерти его помощника и лучшего друга Спока, который в свою очередь положил все силы, чтобы спасти «Энтерпрайз» от неминуемого уничтожения.
Ситуация усугубляется и тем, что Мак-Кой, не менее близкий приятель капитана, теряет рассудок «прямо на глазах».
Тем временем Зарек – отец погибшего – своим появлением у Джеймса дарит ему надежду и рассказывает о том, что его сын на самом деле жив и находится где-то на Генезисе.
Герой, немного приободрившись, угоняет транспорт, предназначенный для утилизации отходов, и улетает, чтобы найти друга. Этим действием он нарушает карантин, который установила Федерация.
Одновременно с этим информация о существовании планеты просачивается к клингонцам, и боевой корабль под предводительством капитана Крюге тоже следует к Генезису.
Однако бывалая команда, приложив усилия, избавляется от инопланетных врагов. Но радости все нет. Ведь их цель – Спок. И… капитан видит лучшего друга, при этом осязаемого и живого. Все вместе они отправляются назад – на Землю.
И пускай руководство накажет всю команду, но членов экипажа это мало волнует. Ценности дружбы намного важнее каких-то выговоров и звезд на погонах…