Доктор Хомяусвилль нанял капитана Ганту, чтобы тот доставил с Земли эксперименты, над которыми когда-то работал Джамба. Ганту врывается в дом героев, находит контейнер с экспериментом номер 625 и решает заодно похитить Джамбу, чтобы допросить. Лило и Стич пытаются преследовать похитителя, но у них ничего не выходит.
В доме Лило, Стич и Пликли обнаруживают спрятанный Джамбой контейнер. Пликли догадывается, что это остальные эксперименты, которые находятся в деактивированном состоянии. Лило и Стич активируют эксперимент под номером 221, и он тут же сбегает.
Тем временем Хомяксвилль пытается разговорить Джамбу и угрожает ему экспериментом 625, но хотя тот и имеет все способности Стича, но невероятно ленив и труслив. Между тем Хомяксвилль разговаривает с Пликли и говорит, что отпустит их друга только в обмен на остальные 624 эксперимента.
Лило и Стич тем временем ловят беспокойного 221-го, которого решили назвать Спарки. Герои отправляются на точку обмена, чтобы вернуть Джамбу, но Лило заявляет, что все эксперименты, включая Спарки – сородичи Стича, а поэтому не собирается отдавать их. Им удается спасти Джамбу, но Хомяксвиллю удалось завладеть контейнером с остальными экспериментами.
Лило, Стич и Спарки проникают на корабль злодея и крадут контейнер, но во время борьбы эксперименты из него разлетаются по всем Гавайям. Вместе им удается победить злодеев, но теперь предстоит найти остальные 623 эксперимента, которые вот-вот активируются.
