Третий год учёбы Гарри и его друзей в Хогвартсе должен начаться 1 сентября 1993 года. В конце августа Гарри в очередной раз значительно ссорится с семейством Дурслей, случайно наводит раздувающий сглаз на тётю Мардж (Гарри был разъярён её оскорблениями в адрес своих родителей) и уходит из дома, забрав все вещи. На улице ему кажется, что за ним кто-то следит. В кустах он замечает странную чёрную собаку и вытаскивает волшебную палочку, но, оступившись, падает, и тут на дороге появляется волшебный трёхэтажный автобус «Ночной Рыцарь», а собака исчезает.
«Ночной Рыцарь» привозит Гарри в паб «Дырявый Котёл», где его ждут друзья — Рон и Гермиона. Но радость от встречи омрачена: министр магии Корнелиус Фадж сообщает, что из тюрьмы Азкабан бежал Сириус Блэк, которого считают тёмным волшебником и последователем Волан-де-Морта. Скорее всего, он захочет убить Гарри. Артур Уизли, отец Рона и сотрудник Министерства магии, просит Гарри не искать Сириуса. Гарри озадачен: зачем ему искать того, кто хочет его убить? В поезде друзья садятся в купе, где в углу спит новый учитель по защите от тёмных искусств — Римус Люпин. Они обсуждают побег Сириуса Блэка, но, не доехав до школы, поезд вдруг останавливается.
Становится очень холодно, и кто-то идёт по коридору, а когда дверь в купе открывается, друзья видят страшное существо в чёрной мантии — дементора. Гарри слышится женский крик, а затем он теряет сознание от атаки дементора. Профессор Люпин просыпается и, пользуясь особым защитным заклинанием «Экспекто Патронум», выгоняет дементора из купе, и тот отступает. Приехав в Хогвартс, Гарри, Рон и Гермиона узнают, что по распоряжению Министерства магии, их школу теперь будут охранять дементоры — жуткие стражи Азкабана, ищущие Сириуса Блэка. Гарри просит Люпина научить его защитному заклинанию против дементоров.
Люпин соглашается проводить тренировки, но в полнолуние он почему-то прерывает их. Уроки по уходу за магическими существами теперь ведёт Хагрид. Этим недовольны слизеринцы (особенно Драко Малфой). На первом уроке Хагрид знакомит детей с гиппогрифом Клювокрылом, который требует к себе большого уважения. Перед тем, как подойти к нему, нужно поклониться. У Гарри это получается, и гиппогриф кланяется в ответ, после чего Гарри совершает свой первый полёт на Клювокрыле, который увенчивается чистым успехом. Малфой же, из-за своего нежелания кланяться перед гиппогрифом, оскорбляет его, получает травму руки и жалуется отцу. В результате из-за этой истории Министерство магии решает казнить Клювокрыла.
Во время зимней прогулки по единственной деревне волшебников, Хогсмиду, Гарри проходит под мантией-невидимкой в бар мадам Росмерты и узнаёт, что разыскиваемый Сириус Блэк — его крёстный отец. Также он был лучшим другом отца Гарри — Джеймса. Считается, что он предал родителей Гарри, когда они прятались от Волан-де-Морта, а также убил Питера Петтигрю — ещё одного друга семьи Поттеров (от него нашли только палец и ничего больше). Гарри хочет найти Сириуса и заставить его ответить за предательство и смерть родителей.
Но однажды в поздний час, глядя на Карту мародёров, подаренную Гарри братьями Уизли на Рождество, он видит, что по Хогвартсу идёт Питер Петтигрю. Гарри выходит из комнаты, но, несмотря на то, что по карте должен был столкнуться с Питером, не видит его. Из-за поворота вдруг появляется профессор Снегг, но на помощь Гарри приходит Люпин. Он взял карту, которую пытался конфисковать Снегг, и сказал, что сам её изучит, а также попросил Гарри зайти к нему в кабинет.
В кабинете Люпин отчитывает Гарри за безрассудство и забирает у него карту. Последний сообщает Люпину, что карта иногда врёт и показывает людей, которые уже давно умерли (к примеру, Питера Петтигрю). Люпин очень удивлён: ведь он знает, что карта никогда не врёт (Гарри невдомёк, что Люпин является одним из её создателей). В день назначенной казни гиппогрифа Гарри, Рон и Гермиона идут к Хагриду, чтобы поддержать его. Они разговаривают, Хагрид возвращает Рону его пропавшую недавно крысу Коросту (до этого ребята считали, что её съел кот Гермионы, Живоглот), но вдруг кто-то бросает в окно камешки: один из них попадает в вазу, а другой ударяет Гарри по голове.
Друзья выглядывают в окно и видят, что к дому Хагрида идут мистер Фадж, Альбус Дамблдор и палач Уолден Макнейр. Гарри, Рон и Гермиона выбегают из дома и бегут к Хогвартсу. По пути Короста вдруг кусает Рона и убегает. Он бежит за ней и ловит, но тут на него нападает чёрный пёс и тащит к Гремучей иве, в корнях которой оказывается секретный вход. Гермиона и Гарри бегут за Роном и собакой. Тоннель приводит их в Визжащую хижину, которая, по преданию, населена призраками.
Призраков здесь не оказывается, но зато в углу обнаруживается Сириус Блэк, собственной персоной. Гарри полностью уверен, что Сириус — предатель, и направляет на него палочку. Но в комнату входит Люпин, а за ним — Снегг. После напряжённой сцены, завершившейся тем, что Снегга оглушают (ему не следовало вмешиваться), Блэк и Люпин объясняют Гарри, что Сириус не предавал родителей Поттера. Это сделал Питер — анимаг, умеющий превращаться в крысу. Оказывается, крыса Рона — это и есть Петтигрю (он отрезал себе палец, чтобы все считали, что он мёртв, а потом взял и превратился в крысу).
Гарри уговаривает Сириуса не убивать Питера, так как этот маг — единственное доказательство невиновности крёстного. Все выходят из хижины, а Сириус предлагает Гарри стать его опекуном и жить вместе с ним. Но тут восходит полная луна, и профессор Люпин превращается в оборотня (он забыл выпить лекарство). Питер, в свою очередь, воспользовавшись моментом, превращается в крысу и сбегает. Сириус превращается в собаку и борется со своим другом. Оборотень более силён, но из леса доносится призывный вой, и оборотень убегает.
Гарри идёт за раненым Сириусом, который падает без сознания на берегу озера. Появляются дементоры. Гарри пытается использовать заклинание «Экспекто Патронум», но быстро теряет силы. На другом берегу озера кто-то вновь применил это сильное заклинание, и волшебный белый олень разгоняет орду дементоров мощным выбросом волшебной энергии. Гарри теряет сознание, а через несколько часов приходит в себя на больничной койке. От друзей и Дамблдора он узнаёт, что Сириус заточён в башне школы и ожидает казни — поцелуя дементора. Питер сбежал, а значит, доказательств невиновности Сириуса нет.
Дамблдор говорит ребятам, что есть шанс спасти невинные жизни, вмешавшись в ход времени. Гермиона принимает совет: у неё есть особое магическое устройство, которое ей дала профессор Макгонагалл, чтобы девочка могла присутствовать на некоторых занятиях, идущих одновременно. Это маховик времени. Гарри и Гермиона перемещаются назад во времени и спасают Клювокрыла и Сириуса, причём как бы помогают сами себе: тот камень, попавший в Гарри в хижине Хагрида, бросила Гермиона. Тот таинственный вой, увлёкший Люпина в обличье оборотня в лес, тоже издала она. И наконец, патронус, спасший Гарри и Сириуса от нападения дементоров — его вызвал сам Гарри, а не его отец, как он предполагал изначально.
Единственное, что расстраивает Гарри — он не сможет жить с крёстным, и ему (то есть Гарри) вновь придётся возвращаться к Дурслям, а тот, кто предал его родителей, вышел сухим из воды и отправился служить Волан-де-Морту. После всех произошедших событий Люпин увольняется из школы, потому что не хочет, чтобы родители детей узнали о том, что в Хогвартсе преподаёт человек-оборотень (кто-то проболтался о двойственной природе Люпина). Он возвращает Гарри Карту мародёров и покидает Хогвартс, пообещав встретиться вновь.
Финальные сцены происходят в Большом зале и перед входом в Хогвартс, когда Сириус прислал своему крестнику Гарри новую метлу «Молния», и последний взмывает на ней в воздух, издавая истошный, но радостный крик.
Отзывы