Минуло десять лет с тех пор, как Джон Коннор и его соратники сумели предотвратить наступление Судного дня. Но это не значит, что с опасными машинами покончено. Герой ведет почти подпольную жизнь, чтобы его нельзя было отследить ни при каких обстоятельствах. Совершенная система «Скайнет» готовится к новому сражению за власть на планете и запускает опасный компьютерный вирус. Только Джон может помешать планам восставших железных убийц. Для уничтожения Коннора в город прибывает новейшая модель киборга-убийцы Терминатрикс в обличье молодой девушки. Она уникальна, сильна и невероятно быстро восстанавливается после пулевых ранений. Жестокая машина кажется непобедимой.
Но на помощь герою вновь является модернизированный Терминатор модели 101. Его немного усовершенствовали и направили к людям с той же миротворческой миссией.
Тем временем, Джон случайно встречается с Кейт Бустер, которая тоже находится в «черном» списке Терминатрикс. Оказывается, ядерная война начнется со дня на день. Остались считанные часы до ее наступления. Но герои не успевают спасти секретную базу от проникновения опасного вируса. Военные в панике, ведь пропала возможность отключить зловещую систему «Скайнет». Киборг Терминатрикс пытается убить Коннора и Кейт, но оказывается поверженной Терминатором 101. Снова могущественный робот гибнет за лидера сопротивленцев.
Героям удается добраться до военной базы и запустить ядерные ракеты. Начинается Судный день, избежать которого было нельзя. Теперь Джон Коннор отчетливо это понимает и берет на себя командование военными. Нелегкие бои с железными монстрами ждут человеческую расу.
