Продюсеры хотели, чтобы Брэд Берд, поставивший фильм «Миссия невыполнима — Протокол Фантом», вернулся в режиссерское кресло, однако он отказался в пользу проекта «Земля будущего» (2015). Его заменил Кристофер МакКуори, причем сам Том Круз попросил продюсеров отдать это место ему.Этот фильм — непосредственное продолжение предыдущей части, в конце которой Итан готовит свою команду к расследованию деятельности Синдиката, ставшего организацией-антагонистом.Организация Синдикат фигурировала в сериале 1966 года и упоминалась в финальной сцене «Миссия невыполнима: Протокол Фантом».Первоначально дата релиза планировалась 25 декабря 2015 года, но затем была перенесена чуть ли не на полгода (30 июля 2015 г.), чтобы избежать конкуренции с такими ожидаемыми фильмами, как «007: СПЕКТР» (2015) и «Звездные войны. Эпизод VII: Пробуждение Силы» (2015).Пола Пэттон и Мэгги Кью должны были вернуться к своим ролям (из частей «Миссия невыполнима: Протокол "Фантом"» и «Миссия невыполнима 3» соответственно), но обе выбыли из-за несогласованности графика съемок.Подзаголовок фильма — «Племя изгоев» (Rogue nation) — породил конфликт между студией Paramount и студией Disney, выпускающей спин-офф к «Звездным войнам»: «Звездные войны: Изгой» («Star Wars Antology: Rogue One»). Студии пришли к соглашению, по которому Disney сможет использовать это название, но не распространит никаких рекламных материалов до тех пор, пока Paramount не выпустит свой фильм.Ради этого фильма Том Круз отказался от главной роли в комедии Гая Ричи «Агенты А. Н. К. Л.» (2015).Бенедикт Камбербэтч стал первым кандидатом на роль главного злодея.Том Круз затаил дыхание на шесть минут для подводной сцены, которая была снята с одного дубля без каких-либо дальнейших поправок.* Том Круз отказался от помощи дублеров и выполнил все трюки в фильме самостоятельно, в том числе трюк с самолетом, где ему пришлось повиснуть на высоте в 1,5 километра над землей.* Во время съемок Круз получил шесть травм.* Том Круз и Винг Реймз – единственные актеры, снявшиеся во всех пяти частях франшизы.Это первый фильм серии, где команда Итана Ханта состоит из персонажей, появлявшихся хотя бы в одной из предыдущих частей.Это второй совместный фильм Тома Круза и Алека Болдуина, после «Рок на века» (2012).Джессике Честейн предложили главную женскую роль, но актриса не пожелала тратить полгода на подготовку к съемкам. Это уже второй раз, когда Честейн отказывается от проекта с Томом Крузом, после «Обливиона».В ранних рекламных материалах автором сценария значился только Кристофер МакКуори, но по требованию Гильдии сценаристов МакКуори остался автором сценария, а вот авторами истории были указаны и он, и Дрю Пирс.Это первый фильм, в котором зрители увидят сцены, снятые новейшей камерой 6.5K Alexa 65 (с ее помощью снимались подводные кадры). Другие фильмы, где также применялась эта камера («Возвращенец», «Алиса в Зазеркалье»), выйдут в прокат позже.Мишель Монахэн и Кэри Рассел, игравшие в предыдущих частях серии, родились в один день — 23 марта. Именно 23 марта вышел трейлер «Миссия невыполнима: Нация изгоев». 
