Действие разворачивается в многострадальном Раккун-сити, где бушует Т-вирус, вырвавшийся на его улицы. Руководство корпорации "Umbrella" принимает решение закрыть город на карантин, не выпуская за его пределы ни одной живой души. В эпицентре бури пересекаются Элис, журналист местного телеканала и несколько сотрудников силовых структур. С ними связывается флагман корпорации доктор Эшфорд, обещая вывести группу из города в том случае, если они вызволят его дочь из школы, кишащей зомби.
В процессе поиска девочки группа несет потери, и к моменту встречи с Эшфордом выживших остается не так уж много. Но и встреча не проходит гладко: Элис и остальных ждет засада в виде руководства корпорации с их супер-оружием – проектом Немезис, в котором героиня узнает своего друга Мэтта. Он тоже вспоминает девушку и помогает ей и ее товарищам по несчастью бежать. Элис добирается до вертолета, ей удается взлететь, но слишком поздно, так как взрывается атомная бомба, сброшенная на город для его зачистки, и вертолет разбивается о землю.
Элис приходит в себя в лаборатории корпорации. Она преисполнена новых сил и, уничтожив своего охранника одним взглядом, выбирается из заточения. Однако теперь проект "Элис" активирован: в финальном кадре в зрачке героини появляется логотип корпорации "Umbrella", а это значит, что все только начинается...
