Следующие несколько лет она довольствовалась небольшими ролями в сериалах и телефильмах, но Гарнер с умом использовала это время для того, чтобы совершенствоваться в выбранной профессии. Режиссёры и кинокритики сразу это отметили, и в 1997 году она получила работу в картине «Площадь Вашингтона» («Washington Square»), в этом исторической драме она играла Мэриэн Элмонд. Начало нового века стало звёздным для Гарнер – её начали приглашать в масштабные голливудские проекты, такие как «Пёрл Харбор» («Pearl Harbor»), «Где моя тачка, чувак?» («Dude, Where's My Car?»).

Если в США зрители её уже немного знали, то мировая известность пришла к Дженнифер после выхода на экраны сериала «Шпионка» («Alias»), где она просто блестяще справилась с главной ролью Сидни Бристоу. Ну а закрепила успех картина «Сорвиголова» («Daredevil»), где она работала с такими именитыми артистами, как Колин Фаррелл и Бен Аффлек.

Сейчас Дженнифер Гарнер снимается в основном в главных ролях, выбирая только те фильмы, которые ей интересны.

В 2005 году актриса вышла замуж за актёра Бена Аффлека, а позднее родила ему двух прекрасных дочерей – Виолетту-Анну и Серафину-Розу. Это не могло не сказаться на её работе, поэтому в последние годы Дженнифер снимается не так часто.