Окончив ВУЗ в1967 году, Филлипенко два года работал в Институте геохимии АН СССР. Ещё с 1964 года Александр начал играть и ставить спектакли в студии МГУ «Наш Дом». Поэтому увлечение артиста театром заставило его покинуть Институт геохимии АН СССР и поступить театральное училище им. Б. В. Щукина. По окончании «Щуки» в 1974 году, Александр Филлипенко был принят в труппу театра имени Вахтангова, в которой проработал целых двадцать лет.
Одной из первых ролей артиста в кино был эпизод в комедии «Бумбараш» 1971 года. Филиппенко сыграл белогвардейского солдата и, несмотря на небольшое пребывание на экране в этом фильме, успел запомниться зрителям. Актёр отличился своим незаигранным умением вживаться в любые образы, поэтому вскоре его начали приглашать на более значимые роли. Так, в 1982 году на экраны советских кинотеатров вышел мюзикл Владимира Грамматикова «Звезда и смерть Хоакина Мурьеты». Филиппенко блистательно исполнил в нём роль Смерти.
Как подчёркивают многие режиссёры, Александр – характерный актёр, работающий по системе Станиславского, поэтому ему без труда удаются любые образы.
В 1985 году вышел приключенческий фильм Сергея Тарасова «Чёрная стрела», в котором актёр сыграл воплощение зла – Ричарда Третьего. Также он отметился участием в экранизации знаменитой повести «Трудно быть богом» братьев Стругацких.
Среди наиболее известных лент с участием Александра Филлипенко стоит отметить «Визит к Минотавру», «Битва за Москву», «Мой друг Иван Лапшин», «Под северным сиянием», «Яма» и другие. В двухтысячных годах артист начал сниматься в сериалах, но не растерял умения перевоплощаться в любые личности, поэтому даже самые банальные роли становились в его исполнении маленькими шедеврами. К примеру, Филлипенко блистательно исполнил Азазелло в экранизации романа Михаила Булгакова «Мастер и Маргарита».
